A história da Latam Airlines Chile data de 5 de março de 1929, quando da fundação da Lan Chile. Em 2004 a companhia passou a ser chamada de Lan Airlines e em agosto de 2010 , junto com a brasileira TAM, formou o Grupo LATAM.
Em agosto de 2015 unificou as marcas LAN e TAM e passou a se chamar oficialmente Latam Airlines, a qual passou a ser a nova denominação da empresa. São Paulo e Rio de Janeiro eram os principais destinos naquele ano. A partir de novembro começou a operar de Guarulhos para Milão, voo que durou até setembro de 2016, quando passou a ser operado pela Latam Airlines Brasil.
No ano da pandemia a Latam Airlines Chile transportou 206.431 passageiros em todas as suas rotas que passaram pelo Brasil e ou terminaram por aqui. Para efeito comparativo, em 2019, foram transportados 670.022 passageiros. Brasília, Florianópolis, Porto Alegre e Rio de Janeiro foram servidas até março de 2020.
Com o vai e volta das ondas da pandemia, Rio de Janeiro teve a retomada dos voos em janeiro de 2021 mas em março foram novamente suspensos.
O Grupo Latam anunciou que retomará as suas operações para Auckland (Nova Zelândia) e Sydney (Austrália) a partir de 29 de março de 2022.