A Abaete iniciou operações em 1995 em Salvador atendendo pequenas cidades no Estado da Bahia. A companhia suspendeu suas operações em 29 de fevereiro de 2012 e desde então somente operou de forma não regular a bordo de suas duas aeronaves Embraer 110 Bandeirante.
Mesmo de forma não regular vinha atendendo as cidades de Alcobaça, Guanambi, Ilhéus, Ipiaú, Irecê, Petrolina, Porto Seguro, Salvador e Uauá.
A empresa voltou a operar de forma regular no final de março de 2022 com voos de Salvador para Cairu, na Bahia, com aeronaves Cessna Caravan.
No final de agosto de 2022 fechou um acordo com a Gol para distribuir passageiros de Salvador para as localidades de Morro de São Paulo, Mucugê, Boipeba e Península de Maraú. Este acordo ainda está sendo implementado.
