Fundada em 2002 com início de operações em 31 de julho, a Lan Ecuador era mais uma empresa que nasceu sob a estratégia do Grupo Lan. Voava de Quito e Guayaquil para Buenos Aires, Madrid, Miami, New York e Santiago com 2 Boeing 767-300ER. Em 2006 recebeu da Lan Airlines um Airbus A320. No ano de 2009 foi autorizada a operar voos domésticos e com isso dois Airbus A318, ex LAN, foram transferidos para a Lan Ecuador. Em 2014 sua frota estava composta por 5 A319 e 1 Airbus A320. No início de 2016 foi renomeada para Latam Airlines Ecuador.
